[
  {
    "id": 1775132476857,
    "url": "https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/35987123/",
    "title": "Bis-enzyme cascade CRISPR-Cas12a platform for miRNA detection",
    "summary": "Researchers developed BPTC, a novel biosensor combining T7 RNA polymerase and CRISPR-Cas12a for highly sensitive miRNA detection. The platform achieves dual-stage amplification with 1 pM sensitivity through phi29-assisted amplification and trans-cleavage activity.",
    "takeaways": [
      "BPTC combines two amplification stages: T7 transcription produces thousands of crRNAs per miRNA, then Cas12a trans-cleaves ~250 fluorescent probes per second",
      "The biosensor shows excellent sensitivity (1 pM) and specificity (99% accuracy) with a ready-to-use, all-in-one detection format",
      "Method avoids complex reverse transcription reactions by using phi29 DNA polymerase for RNA-to-DNA conversion before T7 transcription"
    ],
    "full_content": "MicroRNA (miRNA) play a vital role in the pathological development of many diseases. It is considered to be the diagnosis and potential biomarkers of prognosis. Herein, we proposed Bis-enzyme cascade Platform by combining T7 RNA polymerase and CRISPR-Cas12a (BPTC) for a miRNA detection. In the proposed BPTC, the RNA to DNA conversion ability of phi29 amplification and trans-cleavage of CRISPR-Cas12a are combined. The target miRNA can be amplified after binding to the recognizer ssDNA, and then transcribed the CRISPR-derived RNA (crRNA) by T7 RNA polymerase. The produced crRNA can thereby be assembled by CRISPR-Cas12a and recognized with its target dsDNA, thus triggered its trans-cleavage towards surrounding fluorescent reporters, labeled with a fluorophore and a corresponding quenching group. Based on the bis-enzyme cascade system, the biosensor shows highly sensitivity and excellent specificity. The BPTC shows acceptable sensitivity by combining two stages for amplification. At the first stage, one miRNA can induce thousands of crRNA produce assisted with T7 RNA polymerase. At the second stage, crRNA/Cas12a trans-cleaves FQ probe at a rate of approximately 250 every second which significantly enhanced the response intensity to obtain a more efficient outcome. Besides, the detection strategy of all-in-one based on the BPTC can greatly shorten the detection time. By combination of the molecule amplification technique and Cas12a-actalyzed amplification, the proposed strategy showed a sensitivity of 1 pM and present accurate (99%) feature. Due to the ready-to-use feature, our method differs from most of traditional CRISPR-based sensing systems as this method is more easy-to-operated. The current RNA detection techniques either lack consideration for specificity and universality, are expensive and difficult, or both. Point of care testing (POCT) has important clinical significance for the diagnosis and prognosis evaluation of diseases. At present, the biosensor based on CRISPR/Cas12a has become a powerful diagnostic tool due to its high sensitivity. However, CRISPR/Cas12a requires PAM sequence to recognize target double strand and only can recognize specific sequence, so it is not universal.",
    "folder": "eligo",
    "source": "ios-shortcut",
    "date": "2 Apr 2026"
  },
  {
    "id": 1775131140516,
    "url": "https://fr.wikipedia.org/wiki/CRISPR",
    "title": "CRISPR — Wikipédia",
    "summary": "The French Wikipedia article describes CRISPR as a gene editing system originally discovered in bacteria that has become a powerful genetic manipulation tool. The system functions as a molecular scissors to introduce precise modifications in the genome of various organisms, with applications ranging from disease treatment to research models.",
    "takeaways": [
      "CRISPR-Cas9 is used as molecular scissors to introduce local modifications in genomes of numerous model organisms",
      "The technology enables creation of animal-human chimeras for medical research and organ transplantation studies",
      "CRISPR applications extend beyond gene editing to include diagnostics, manufacturing, sustainability and ecological engineering"
    ],
    "full_content": "En génie génétique, le système CRISPR-Cas9, d'abord utilisé pour typer des souches de bactéries est récemment devenu un outil de manipulation génétique à fort potentiel. CRISPR-Cas9 est notamment utilisé comme ciseau moléculaire afin d'introduire des modifications locales du génome (manipulations souvent qualifiées d'édition génomique) de nombreux organismes modèles. Cette structure répétée a été observée pour la première fois par Yoshizumi Ishino en 1987 chez Escherichia coli. Elle a ensuite été décrite plusieurs fois sous différents noms : LCTR pour Long Clusters of Tandem Repeats. Un article de Juan Francisco Martínez Mojica de 2000 démontre que toutes les descriptions précédentes n'étaient que des facettes d'une seule et même entité. Ces chimères sont des organismes qui contiennent à la fois des cellules humaines et animales, créées par manipulation génétique via CRISPR, afin d'étudier des maladies ou de produire des organes humains transplantables. Ce domaine est encore en développement, notamment au Japon, où le professeur Hiromitsu Nakauchi a reçu en 2019 l'autorisation de créer des embryons chimériques animal-humain. Son équipe vise à faire croître des organes humains dans des embryons de rongeurs, qui seraient ensuite transplantés dans des animaux de substitution, comme des porcs, l'objectif étant de pallier la pénurie d'organes pour les transplantations et représente un potentiel considérable pour la médecine régénérative. En 2021, un exemple concret de cette approche a été mis en œuvre en France avec l'organisation d'un jury citoyen sur l'ingénierie génomique, porté par l'Espace de Réflexion Éthique du Grand Est (EREGE), en partenariat avec l'INSERM et la Conférence Nationale des Espaces de Réflexion Éthique Régionaux (CNERER). Ce jury, composé de citoyens préalablement formés, a discuté des enjeux liés à l'utilisation de CRISPR, en particulier dans un cadre médical. Il a notamment exprimé un avis favorable à l'usage de l'édition du génome dans des indications médicales précises, à condition qu'un encadrement strict soit mis en place. Ces répétitions se rencontrent dans les lignées d'archées et de bactéries, mais n'ont pas encore été observées chez les eucaryotes. Chez les virus, il a été montré que des bactériophages codent le système CRISPR-Cas. Les CRISPR pourraient être la famille de répétition la plus largement répandue dans le monde vivant, avec un peu moins de la moitié des organismes séquencés porteurs de ce type de répétitions. Les régions CRISPR sont présents chez la plupart des archées thermophiles et la moitié des espèces bactériennes, concernant aussi bien les bactéries à Gram+ que les bactéries à Gram-. Rencontrés uniquement dans les génomes porteurs de CRISPR, les gènes Cas (pour associés à CRISPR) sont généralement situés à proximité des locus CRISPR. Le plus important de ces gènes est Cas1, présent dans presque tous les complexes CRISPR-Cas. Les systèmes CRISPR-Cas peuvent être très étendus (jusqu'à 20 gènes différents) et semblent présenter des schémas différents d'une lignée à l'autre. Les gènes Cas repérés chez des organismes hyperthermophiles ont d'abord été vus comme jouant un rôle de réparation de l'ADN.",
    "folder": "eligo",
    "source": "web",
    "date": "2 Apr 2026"
  }
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